ملخص
ان عمليات التصنيع الحيوي تتم داخل المخمرات او المفاعلات الحيوية وعليه فيمكن تعريفها على انها أي وعاء تتم فيه العمليات الحيوية مثل الانزيمات او الخلايا الحية سواء كانت حرة أو مقيدة، مفردة أو مختلطة للحصول على المواد المطلوبة. ان الخلايا المطلوبة داخل المخمر يجب أن تتوفر لها الظروف الملائمة لنموها والتي تتمثل بالمواد الغذائية، مصادر طاقة، تهوية وتقليب وتتم عمليات قياس هذه المؤثرات بوسائل خاصة وعليه فإن المخمر يمثل قلب عملية التخمر. ان المخمرات توفر للعمليات الصناعية الظروف أو البيئات الملائمة وتتمثل هذه في : 1. البيئة الحيوية : ويقصد بها توفير الخلايا المنتجة باعداد كافية للانتاج الاقتصادي واستبعاد الثلوث، فالنظام الحاوي على نوع واحد من الخلايا يطلق عليه النظام المعقم ويعني العمل في وعاء معزول بعد تعقيمه وكذلك تعقيم الوسط الغذائي وادخال الكائن المطلوب كلقاح ويستوجب هذا أخذ الاحتياطات اللازمة عند مداخل ومخارج المخمر لمنع التلوث. 2. البيئة الفيزياوية :وهي تتناول بشكل رئيسي الحرارة واجراء اللازم للمحافظة على المحتويات بدرجة حرارية مناسبة. 3. البيئة الكيمياوية : وتعني توفير المواد الغذائية اللازمة لنمو الاحياء وبالتراكيز الملائمة بالاضافة الى توفير الطلائع الاولية اثناء بعض العمليات الانتاجية. كما تشمل المحافظة على الارقام الهيدروجينية الملائمة، تركيز الاوكسجين وابعاد المثبطات مثل ابعاد الاوكسجين من التخمرات اللاهوائية وكذلك ابعاده في حالة انتاج المواد القابلة للاشتعال مثل انتاج الميثان، وازالة ثاني اوكسيد الكربون وغيرها من النواتج، ويمكن ان تشمل النواحي الكيمياوية كالنشاط المائي وتوفره بالقدر المطلوب، كما أن عمليات التخمر يمكن أن تتم بشكلين الاول في الانظمة المفتوحة والتي لاتحتاج الى تعقيم والاخرى المغلقة التي تتم تحت ظروف معقمة.